1. бегло знакомимся со словами и выражениями к уроку - тонизация и значение (перевод и грамматический комментарий, CD 1-3 или софт)
2. изучаем грамматику (перевод и грамматический комментарий)
3. прорабатываем модели предложений, примеры и диалог (основной учебник + CD 1-3 или софт, а также перевод и грамматический комментарий) и параллельно основательно учим слова и выражения (перевод и грамматический комментарий, SRS)
4. (опционально) смотрим видео к диалогам (если есть), обращая внимание на невербальный аспект общения
5. делаем упражнения A, B и C (основной учебник + CD 1-3 (только для упражнений C) или софт, в котором озвучены все упражнения)
6. выполняем задания (основной учебник + CD 4 или софт)
7. (опционально) занимаемся по вспомогательным материалам к уроку (перечисляю в том порядке, который мне кажется наиболее логичным для изучения):
7.1. пособие по изучению иероглифов* - части I и II проходим параллельно с изучением уроков 1-5, часть III проходим по схеме: после уроков 5, 10, 15, 20-25
7.2. дополнительные материалы для аудирования - после каждого урока
7.3. рабочая тетрадь по грамматике (sentence pattern workbook) - после каждого урока
7.4. грамматические тесты - после каждого урока, начиная со 2-го урока
7.5. книга для чтения - разминка (warm-up) 1-5 - после 5-го урока, основная часть (main text) - после каждого урока, начиная с 6-го урока
7.6. рабочая тетрадь для практики письма - после уроков 6, 10, 13, 16, 19, 22, 25

Основной учебник - сюда входит собственно учебник на японском языке, аудио материалы к нему (4 CD), перевод и грамматический комментарий (на русском, английском или другом языке). В эту же категорию я включаю софт по MNN, который заменяет собой японский учебник и аудио материалы.

Вспомогательные материалы - видео к диалогам, дополнительные материалы для аудирования, грамматические тесты, рабочая тетрадь по грамматике (sentence pattern workbook), пособие по изучению иероглифов, книга для чтения, рабочая тетрадь для практики письма.