Глобальный режим
Один из режимов аддона позволяет игрокам передвигать армии по карте мира в стиле настольной игры «Risk». Встреча вражеских армий разрешается либо в реальном времени, либо с помощью тактического ИИ. Войска оставшиеся в конце битвы остаются с армией пока не погибнут. Победа в глобальном режиме — уничтожить все базы противника. Альтернативная победа у каждых сторон разные: Скрины — построить 9 вышек-пределов на базах 3-го уровня, GDI — захватить 33 % территорий, Нод — достигнуть максимального уровня бунтов в 24-х городах.
Кампания
В отличие от других стратегий серии, «Kane’s Wrath» имеет лишь одну кампанию, со стороны Братства. Интересно то, что эта кампания состоит из трёх различных временных периодов, описывающих историю Кейна. Первый акт происходит между «Tiberian Sun: Firestorm» и «Command & Conquer 3»; второй акт — во время событий «Command & Conquer 3»; а третий акт начинает историю того что будет после событий третьей игры, оставляя игрока с вопросом «что дальше?»
Под-фракции
Каждая из трёх фракций серии (GDI, Братство Нод и скрины) получают по две дополнительные «под-фракции» в аддоне. Каждая из этих под-фракций имеет уникальные войска, улучшения и способности, и созданы для более специфических стилей игроков. Эти под-фракции увеличивают общее количество играемых сторон в «Command & Conquer 3» до девяти.
Global Defense Initiative
Новые войска
«Торнадо» — зенитная машина на воздушной подушке, вооружённая счетверёнными пулемётами.
«Громовержец» — звуковой танк, чей выстрел может уничтожить нескольких врагов за раз.
«Молот» — пулемётный вертолёт не требующий перезарядки или топлива; может содержать один отряд пехоты
Стальные когти (англ. Steel Talons)
Экспериментальный батальон созданный после Второй Тибериевой Войны. Эта группа специализировалась на полевых испытаниях самых передовых технологий GDI до того как командование решило уйти от их традиционной доктрины превосходящей огневой мощи к улучшению космических технологий. Бронетехника Стальных когтей включает в себя несколько видоизменённую технику из «Tiberian Sun»: ходячие танки модели «Титан», развед-экзоскелеты «Росомаха» и ходячая артиллерия «Бегемот» (вариация «Джаггернаута» с бункером для пехоты на «спине»). Звуковые технологии эры «Tiberium Wars» ими не используются (в рамках программы "Чистый мир - без тиберия", ведь новейшие технологии требуют тиберия для функционирования), но их оборонные орудия могут быть улучшены рельсотронами. Также были сделаны небольшие улучшения для стандартных войск: инженеров вооружили пистолетами, харвестеры получили бункер для пехоты, а бронетранспортёры теперь могут ремнотировать технику в полевых условиях взамен на пулемёт. Техника Стальных когтей может быть улучшена тяжёлой бронёй блокирующей электромагнитные импульсы. Взамен на эти улучшения, Когти не имеют более совершенной пехоты и некоторых высококлассных способностей регулярных войск GDI.
Чистильщики (англ. ZOCOM)
Командование зональных операций — элитное подразделение созданное после Третьей тибериевой войны, состоящее, в основном, из ветеранов, высокотехнологичных солдат GDI, оборудованных для борьбы с планетарным тибериевым заражением и очищением Красных зон Земли. Войска Чистильщиков обращаются с технологиями связанными с последними достижениями в области звукового оружия, особой телесной брони способной противостоять разрушительному эффекту тиберия, а также тактиками подавления. Эта под-фракция заменяет стандартных Штурмовиков на «Рейдеров внешней зоны»(англ. Zone Raider,далее-Штурмовесс) - специально обученных девушек-пехотинцев в новой противотибериевой броне, вооружённой зенитными ракетами и звуковыми гранатомётами. Их «Косатки» и Штурмовессы тренированы в использовании особых звуковых гранат вместо стандартного оборудования. Также, Чистильщики получают мощнейшую версию нововведённой бронетехники класса «Громовержец». Стандартная телесная броня пехоты ГСБ у Чистильщиков заменена на более эффективные полевые тибериевые скафандры.
Братство Нод
*Новые войска
«Харон»(англ. Reckoner APC) — тяжёлый бронетранспортёр с бойницами; при получении критических повреждений или по приказу превращается в постоянный бункер. В состоянии бронетранспортёра может содержать 2 отряда пехоты, в состоянии бункера - 3.; огонь ведётся только из развёрнутого транспортника. Высокая защищённость от всех видов оружия, солдаты не могут быть уничтожены ни гранатами, ни огнемётами, ни «Осами».
«Фантом» — САУ со встроенным стелс-генератором. Представляет собой грозную силу, особенно при поддержке танков Призрак и отрядом Теней.
Чёрная Рука (англ. Black Hand)
Ужасающий орден жрецов-воинов Братства, специализирующийся на мощных и тренированных штурмовых войсках. Стандартной пехотой Черных братьев является отряд Наставников, вооружённых галлюциногенными гранатами и противопехотными пулемётами Гатлинга, которые можно улучшить «ионными тибериевыми» снарядами, наносящими сильный урон вражеской пехоте и лёгкой технике. Дружественная пехота вблизи Исповедников увеличивает свою скорострельность, выносливость и приобретает сопротивление к подавлению. Вся пехота Чёрной руки тренируется на уровне ветеранов, а их коммандо сразу получают максимальный уровень опыта. Командирам Чёрной руки позволяется иметь одновременно два коммандо на поле боя. Войска Чёрной руки также включают в себя предшественников механизированных шагоходов класса «Мародёр», «Очистителей», которые, кроме мощного лазерного орудия, также вооружены короткодистанционным огнемётом и устройством подавления пехоты. Взамен, «Очистители» не могут улучшать себя дополнительными устройствами, как это может «Мародёр». Все огнемёты этой под-фракции могут быть улучшены для большего урона врагу. Взамен на все эти способности, Чёрная рука не имеет никаких стелс-технологий или ВВС. Взамен на стелс-танк, Чёрная рука ввела на вооружение роботизированную зенитную машину «Богомол» (локализаторы ошибочно назвали её «Призрак», хотя это как раз тот самый стелс-танк).
Избранные Кейна (англ. Marked Of Kane)
Эта злобная под-фракция не только предпочитает использовать стелс-технологии Братства, но также почти целиком использует радикальные тибериевые технологии и вооружение. Меченные Кейном заменяют плохо тренированные отряды автоматчиков киборгами класса «Пробуждённые»(англ. Awaneked). Эта тяжёлая пехота с лёгкостью расправляется с пехотой врага и способна отключать вражескую технику электромагнитными импульсами. Элитные киборги класса «Просветлённые»(англ. Enlighted) сравнимы по эффективности с Штурмовиками GDI и вооружены лучевым оружием и более мощными генераторами ЭМИ. Эти киборги, вместе с саботёрами этой под-фракции, могут быть кибер-улучшены, позволяя им быстрее перемещаться по полю боя. Штурмовые отряды Чёрной руки были заменены на новую Тибериевую пехоту, оружие которых заражает врага тиберием и очищает оккупированные здания. Избранные Кейна также получают смертоносные магнитные мины которые постепенно уничтожают технику врага и используют сверхоружие, основанное на тиберии.
Скрины
*Новые войска
«Охотник» — самый быстрый тип пехоты в игре, созданный для партизанских атак на комбайны и базы врага.
«Механоид» — гусеница, чьи сегменты представляют собой био-машины, имеющие собственное оружие.
Секта «Жнецов» (англ. Reaper-17)
Эта штурмовая фракция скринов имеет тяжёлую бронетехнику и более эффективные методы сбора тиберия. Взамен на эту наземную мощь, секта «Жнецов» не имеет ни ВВС (кроме «Буревестников») ни технологий гипноза. Эта под-фракция имеет на вооружении «Тибериевый Танк» и улучшенную версию «Аннигилятора», «Потрошитель», который использует тиберий, как и танк «Поглотитель». «Жнецы» имеют более продвинутые энергощиты, которые могут даже блокировать ЭМИ. Осколочные орудия этой под-фракции также могут использовать синий тиберий, который наносит больше урона за счёт своей нестабильности. Комбайны и лёгкие танки имеют собственные энергощиты.
Секта «Странников» (англ. Traveller-59)
Полная противоположность «Жнецам». Секта «Странников» полагается на скорость и контроль разума врагов. Вместо Манипуляторов они имеют Владыку Иллюзий. Также они имеют Сектантов — Гибрид Владыки и обычного человека, который может контролировать врага, при этом можно создавать бесконечное число Сектантов. Так как «Странники» полагаются на скорость и контроль разума в их войсках отсутствует танк Скриннов «Поглотитель». Также авиация «Странников» летит быстрее авиации обычных Скриннов.
Прототипы
Каждая фракция имеет прототипы.
GDI
«СТ-ТМ» (СверхТяжёлый Танк Мамонт)(Mammoth Armed Reclamation Vehicle, MARV) — огромный шестнадцатигусеничный танк, основанный на базе «Мамонта». Вооружён трёхствольным башенным орудием, стреляющим звуковыми снарядами. В прототипе есть четыре ячейки пехоты, в зависимости от пехоты, засевшей там, меняется предназначение огневой точки (Стрелки - пулемётная точка; Ракетомётчики - управляемые ракеты; Инженеры - ремонтный блок; Снайперы - снайперская точка; Штурмовики - Гаусс пушки ;Штурмовики "Чистильщиков" -звуковое оружие ). На базе сверхмамонта установлен прототип перерабатывающего завода, так как, переезжая по полю тиберия, он его автоматически собирает и превращает в кредиты. Медлителен и неповоротлив, но обладает хорошей броней. Модификации СТ-ТМ
Нод
«Искупитель»(в официальной локализации «Мститель», англ. Redeemer) — огромный четырёхногий механизированный шагоход, внешне похожий на «Мародёра», который может содержать в себе два отряда пехоты для улучшения огневой мощи и специализации (автоматчики — тяжёлый пулемёт, ракетчики — управляемые ракеты, саботёры (Техники) — саморемонтное устройство, отряд солдат ордена Черной руки — огнемёт, отряд химических бойцов — Тибериевое оружие). Наибольшую разрушительность обретает при слиянии с отрядом солдат ордена Черной руки (Огнемёты уничтожают пехоту, здания и лёгкую технику, стандартная лазерная пушка отлично уничтожает бронированный транспорт). Хотя «Мститель» не имеет харвестерских способностей эпических единиц GDI или скринов, он всё же имеет мощный «генератор ярости», заставляющий вражеские войска стрелять друг в друга. Кроме того, он имеет наиболее мощный удар среди всех эпических юнитов и при схватке один на один побеждает два других. Модификации Мстителя.
Скрины
«Ликвидатор» — гигантский паукообразный биомеханизм, способный получать ресурсы из вблизи убитых врагов. Стреляет плазменными дисками. В него может быть интегрирована пехота Скриннов (максимум 3 отряда). Перемещается на планету через портал на Улье. Подключаемые модули Ликвидатора.

Первый акт
Кейн входит в бункер глубоко под землёй, почти полностью исцелённый кроме лица (он всё ещё носит маску из второй части). Он приказывает едва функционирующему ЛЕГИОНу начать восстание в Рио-де-Жанейро, уничтожая местное отделение GDI и Нодов-предателей. После успешного выполнения задания, Кейн рассказывает системе о своём плане воссоединения отделившихся фракций Нода. Так как раскрывать себя миру слишком рискованно, Кейн выбирает брата Маркиона, лидера «новой» Чёрной руки, изъявлять свою волю Братству. Игрок затем должен уничтожить базу Маркиона и схватить его. Представ перед Кейном (уже без маски), Маркион возвращается на его сторону. Кейн затем приказывает уничтожить лаборатории GDI по исследованию жидкого тиберия в Австралии, что заставит остальные фракции Нод объединиться. Командующему он говорит «Время спать… и видеть… сны», после чего экран плавно затухает, что изображает отключение ЛЕГИОНа.
Второй акт
Игрок просыпается в образе суперкомпьютера, подобного CABAL. Кейн начинает готовиться к уничтожению космической станции «Филадельфия», приказывая игроку (ЛЕГИОНу) выкрасть планы для сети орбитальных ионных пушек. Понимая что уничтожение «Филадельфии» обезглавит GDI, Кейн решает сделать Редмонда Бойла своей пешкой, чтобы заставить его нанести удар сверхоружием (орбитальным спутником-ионной пушкой) по Храму Нод в Сараево, что вызовет цепную реакцию тиберия по всей планете и тем самым привлечёт «гостей» — Скриннов.
Игрок получает приказ схватить доктора Жиро, что объясняет его отсутствие в C&C3. Тем временем, аббатка Алекса Ковач решает обвинить генерала Киллиан Катар в предательстве и приказывает игроку помочь уничтожить главный храм Нода притворяясь Катар. Ковач ненавидит ЛЕГИОНа, ведь он был создан на основе Computer Assisted Biologically Augmented Lifeform (CABAL).
Перехватив Тацит в Китае, неожиданно появляются Скринны. Похоже они гонятся за Тацитом, но им это не удаётся.
Во время исполнения задания для Кейна по извлечению Тацита, Ковач заражает ЛЕГИОНа вирусом, после чего Кейн приказывает арестовать её. Прежде чем её могут увести, Ковач выхватывает пистолет и, выкрикнув ритуальную фразу Нод «Нам нужен мир», убивает себя и экран гаснет
Третий акт
ЛЕГИОН пробуждается после Третьей Тибериевой войны, и Кейн приказывает ему вернуть Тацит, так как изучение этого устройства в руках GDI привело к тому что Тацит стал нестабильным. Кейну необходим Тацит для его грандиозного плана, поэтому он сперва приказывает ЛЕГИОНу пробудить Меченных Кейном, фракцию киборгов под прямым контролем ЛЕГИОНа. После успешной реактивации, Кейн посылает игрока забрать Тацит из лаборатории GDI в Скалистых горах. После успешного извлечения устройства, Кейн подключает Тацит к ЛЕГИОНу, и этот ИИ получает огромный объём знаний, после чего нам показывают ролик, в котором в конце появляется надпись на языке скринов: «Межпространственный портал активирован».